More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4799 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4799  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  480  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4888  ABC transporter related  95.04 
 
 		 242 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7089  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.53 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5537  ABC transporter related  48.93 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0407742  hitchhiker  0.00000719061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6135  ABC transporter related  45.3 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5243  ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  44.4 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  46.84 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  46.35 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7436  ABC transporter  46.98 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  47.01 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.1 
 
 		 237 aa  191  6e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  43.4 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  43.35 
 
 		 236 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.81 
 
 		 249 aa  191  9e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  44.16 
 
 		 258 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  44.02 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3770  ABC transporter related  41.25 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0248  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3664  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  43.97 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  43.97 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  44.02 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  42.62 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  46.35 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  43.04 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  43.35 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3369  ABC transporter related  41.32 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  43.16 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  43.1 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  42.74 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  43.97 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  43.78 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  43.97 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  43.97 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  43.16 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 238 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  42.86 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  42.49 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  44.96 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 233 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  42.74 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  43.16 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  43.4 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0102  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  41.99 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2426  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  42.49 
 
 		 437 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.67 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  41.45 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.38 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 238 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.72 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  41.38 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  44.83 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.1 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  40.09 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  40.17 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  43.35 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>