More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5537 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5537  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0407742  hitchhiker  0.00000719061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7436  ABC transporter  73.95 
 
 		 241 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6135  ABC transporter related  57.08 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5243  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4799  ABC transporter related  48.93 
 
 		 242 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.94 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4888  ABC transporter related  48.5 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7089  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.87 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  47.41 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  43.29 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  45.08 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.22 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  47.21 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  47.64 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  45.3 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  45.26 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  45.49 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  47.01 
 
 		 823 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.21 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  44.67 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  45.69 
 
 		 437 aa  201  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  46.35 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  46.98 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  42.98 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  46.15 
 
 		 830 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  43.33 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1851  ABC transporter related  45.92 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0531443  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  45.89 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  47.01 
 
 		 243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  47.86 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  43.33 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  44.26 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  45.96 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0109  ABC transporter related  43.75 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2963  ABC transporter related  43.75 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0092  ABC transporter related  43.75 
 
 		 251 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  46.58 
 
 		 823 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  48.29 
 
 		 246 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  44.87 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  46.32 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  43.75 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.3 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.73 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  45.92 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.7 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.64 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  44.64 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  43.85 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  45.26 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.35 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  44.3 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.64 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 234 aa  195  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  45.92 
 
 		 264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3234  ABC transporter related  43.57 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  44.64 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  44.64 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  44.64 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.15 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  46.81 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  44.92 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  44.44 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0263  ABC transporter related  44.44 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  40.6 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.13 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  44.83 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  45.96 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  46.35 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  45.49 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  44.64 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  42.13 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2281  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>