More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2899 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  60.89 
 
 		 840 aa  941    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  62.75 
 
 		 863 aa  970    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  67.7 
 
 		 840 aa  985    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  66.95 
 
 		 840 aa  1000    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  58.45 
 
 		 838 aa  918    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  100 
 
 		 852 aa  1658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  40.93 
 
 		 842 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.84 
 
 		 859 aa  532  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  39.36 
 
 		 823 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  39.09 
 
 		 823 aa  429  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  40.2 
 
 		 827 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  37.29 
 
 		 830 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  38.31 
 
 		 828 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  36.59 
 
 		 832 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  38.48 
 
 		 822 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  43.4 
 
 		 484 aa  333  9e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  39.74 
 
 		 536 aa  318  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  35.91 
 
 		 621 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  38.96 
 
 		 502 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  38.15 
 
 		 597 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  38.3 
 
 		 501 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  37.73 
 
 		 594 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  38.53 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.84 
 
 		 489 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  32.36 
 
 		 873 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.55 
 
 		 594 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  34.22 
 
 		 594 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  33.89 
 
 		 594 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  34.22 
 
 		 594 aa  270  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  33.67 
 
 		 593 aa  269  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.67 
 
 		 593 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.44 
 
 		 632 aa  268  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  40.95 
 
 		 504 aa  267  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  36.65 
 
 		 494 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  37.98 
 
 		 549 aa  265  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  33.06 
 
 		 594 aa  263  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  38.14 
 
 		 505 aa  262  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  33.72 
 
 		 594 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  31.8 
 
 		 625 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  34.88 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  33.55 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 594 aa  259  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  36.08 
 
 		 490 aa  252  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  32.3 
 
 		 555 aa  251  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6071  ABC transporter related  31.31 
 
 		 615 aa  250  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.461067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.78 
 
 		 594 aa  250  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 589 aa  248  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  34.45 
 
 		 606 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  33.95 
 
 		 599 aa  243  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  33.96 
 
 		 589 aa  241  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  33.84 
 
 		 573 aa  240  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  34.2 
 
 		 608 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  33.71 
 
 		 593 aa  240  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  32.57 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  35.24 
 
 		 611 aa  239  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  31.07 
 
 		 594 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  30.91 
 
 		 594 aa  239  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  31.99 
 
 		 663 aa  236  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 250 aa  234  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  32.48 
 
 		 611 aa  234  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  33.51 
 
 		 590 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  33.1 
 
 		 590 aa  233  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.58 
 
 		 594 aa  233  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 250 aa  232  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  34.17 
 
 		 589 aa  232  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  30.41 
 
 		 660 aa  230  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 		 608 aa  230  8e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1308  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.65 
 
 		 620 aa  230  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.832531  normal  0.97267 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.89 
 
 		 609 aa  230  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  30.11 
 
 		 648 aa  229  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  33.17 
 
 		 614 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  31.52 
 
 		 593 aa  227  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  33.33 
 
 		 565 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3235  inner-membrane translocator:ABC transporter related  32.94 
 
 		 597 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0695796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  33.97 
 
 		 589 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  34.76 
 
 		 612 aa  224  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5697  ABC transporter related  29.48 
 
 		 585 aa  224  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.435877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6650  ABC transporter related  29.64 
 
 		 585 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154818  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  31.46 
 
 		 603 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  32.27 
 
 		 606 aa  220  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4424  ABC transporter related  32.36 
 
 		 601 aa  220  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.612186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5902  ABC transporter related  31.55 
 
 		 616 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656172  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  31.6 
 
 		 616 aa  219  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  32.29 
 
 		 679 aa  218  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1891  ABC transporter related  34.05 
 
 		 589 aa  218  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.553447  normal  0.571968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0054  ABC transporter related  31.63 
 
 		 604 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  30.43 
 
 		 647 aa  216  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  32.89 
 
 		 588 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  36.3 
 
 		 604 aa  214  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  31.79 
 
 		 583 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  32.66 
 
 		 678 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5329  ABC transporter related  36.83 
 
 		 586 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  45.08 
 
 		 250 aa  212  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  32.66 
 
 		 604 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>