More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4997 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4997  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  44.59 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.29 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  42.8 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 238 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  41.1 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  41.1 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  42.06 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  42.06 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  47.42 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  43.97 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  39.83 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  43.4 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  41.7 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  42.17 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  42.17 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  41.28 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  41.38 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0502  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.28 
 
 		 237 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0108614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  41.53 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  41.41 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  44.02 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  40.6 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  41.03 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  41.03 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  40.25 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  43.97 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  44.86 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  41.74 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.46 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  40.6 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  40.09 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  44.6 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  37.87 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  41.38 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  45.16 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.38 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  44.5 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  41.63 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  42.86 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  40 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  43.66 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  38.53 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.06 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  43.52 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  43.13 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  42.98 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  40.77 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  40.52 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.02 
 
 		 484 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  42.13 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.66 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  43.64 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.21 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  43.38 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  44.65 
 
 		 235 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  41.81 
 
 		 241 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  43.38 
 
 		 259 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  41.55 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  41.53 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  40.95 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  44.7 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.26 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  38.46 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  41.59 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  42.4 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  40.76 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  42.42 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  42.2 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.23 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  41.13 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.95 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  38.53 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  41.63 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  40.27 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.47 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  42.52 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  38.46 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  38.16 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  39.64 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  38.16 
 
 		 231 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  43.16 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  39.47 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  40.76 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  40.85 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.91 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  40 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>