More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2717 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2946  ABC transporter related  89.18 
 
 		 231 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1287  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  88.74 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.4 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  47.84 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  42.19 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  46.33 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  46.35 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  47.09 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.73 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.27 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.99 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  45.57 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.27 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.23 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  45.33 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  47.09 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  45.62 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  45.45 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.15 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.64 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  46.12 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  45.61 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  48.15 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.35 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  48.11 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  44.83 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.73 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  46.98 
 
 		 852 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.7 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  42.74 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  47.27 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.64 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  43.29 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  45.99 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  45.69 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  46.22 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.47 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  46.64 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  45.45 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  47.06 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  40.34 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.16 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.27 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.88 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  42.31 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  45.45 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1294  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  47.26 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1851  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0531443  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  46.78 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  47.58 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  47.27 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  47.27 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  47.27 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  47.27 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  48.18 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  41.45 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  45.75 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  46.36 
 
 		 231 aa  184  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  45.89 
 
 		 484 aa  184  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  43.46 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  47.32 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  45.11 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  46.51 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  43.64 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  45.37 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  45.18 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  44.59 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.75 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  48.11 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  44.26 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  46.82 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  42.06 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  45.07 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  43.88 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.59 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  45.28 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  45.02 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>