More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0805 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  59.49 
 
 		 235 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2667  ABC transporter related  49.58 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  47.7 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3016  ABC transporter related  48.32 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 232 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  45.38 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.91 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  46.73 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.8 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4225  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.11 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.195928  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.4 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  40.93 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  46.05 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.98 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  46.51 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  41.7 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.12 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  42.44 
 
 		 852 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.55 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  43.51 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  47.32 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  42.13 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.28 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  39.82 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  40.51 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  46.05 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  45.83 
 
 		 231 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.41 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  40 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  39.91 
 
 		 838 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  43.26 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.61 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  39.25 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.15 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  43.26 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  43.26 
 
 		 247 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.57 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.79 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4187  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.55 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  39.15 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  39.15 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.7 
 
 		 231 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.33 
 
 		 237 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.86 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.7 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.91 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  45.16 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0230  response regulator receiver domain-containing protein  43.28 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562964  normal  0.557088 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.4 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.57 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.16 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  43.1 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  41.28 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  41.86 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.95 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  37.82 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3506  ABC transporter related  41.28 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0951975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.25 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.26 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.78 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.77 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  40 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  39.24 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  40 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  39.39 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  40.91 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2946  ABC transporter related  47.32 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  41.28 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.57 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  39.21 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1252  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.74 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1023  ABC transporter related  41.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3802  ABC transporter related  41.01 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1336  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.784169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19151  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  46.43 
 
 		 235 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  42.33 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1044  ATPase  46.43 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.1 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>