More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3206 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3016  ABC transporter related  84.45 
 
 		 237 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2667  ABC transporter related  84.03 
 
 		 237 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  67.23 
 
 		 236 aa  314  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  53.98 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  49.36 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  46.69 
 
 		 239 aa  214  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.56 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.56 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  48.53 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  48.53 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  45.58 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.4 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  47.01 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  47.17 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.79 
 
 		 230 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.21 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.55 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.02 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.6 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 234 aa  201  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.15 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  46.12 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.15 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  46.6 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  46.3 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  44.92 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  47.37 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.26 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.64 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  46.46 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  48.53 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.69 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4225  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.57 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.195928  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 229 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.25 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.16 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  47 
 
 		 823 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  44.93 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  44.54 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  47 
 
 		 823 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.53 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  47.12 
 
 		 247 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  44.25 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  45.67 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  46.01 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  46.51 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.79 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29701  putative ATP-binding subunit of urea ABC transport system  49.32 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  48.13 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 243 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  45.62 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  46.08 
 
 		 822 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  44.86 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  43.16 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.42 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.95 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.19 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  45.61 
 
 		 248 aa  185  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.15 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.66 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  43.46 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  45.16 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.53 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.44 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.04 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.89 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.83 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.83 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.39 
 
 		 254 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.53 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1957  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  45.63 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4153  ABC transporter related  42.48 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  43.5 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.29 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.33 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  45.49 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.11 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  42.06 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>