More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3318 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  67.23 
 
 		 238 aa  314  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2667  ABC transporter related  69.07 
 
 		 237 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3016  ABC transporter related  67.8 
 
 		 237 aa  304  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  53.02 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  56.28 
 
 		 241 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  47.7 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  49.57 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3489  ABC transporter  47.84 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  48.71 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  47.21 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  47.21 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.55 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.21 
 
 		 230 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.41 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.69 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  45.61 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.15 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.78 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4188  ABC transporter related  44.83 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.41 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.68 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.98 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.98 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.26 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.26 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  47.64 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.24 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.13 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.95 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.09 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.26 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4225  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.53 
 
 		 257 aa  197  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.195928  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.55 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  48.72 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  47.39 
 
 		 251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.04 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7014  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.18 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.83 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  47.64 
 
 		 247 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  44.44 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.13 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  43.1 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  50.22 
 
 		 246 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  45.26 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  49.32 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 241 aa  191  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.24 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.04 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2699  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  44.44 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.834948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  49.78 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0125  ABC transporter related  44.87 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.550206  normal  0.120761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2157  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.07 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.360084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.22 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  42.24 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2496  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.07 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0491391  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  42.92 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  42.49 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  47.79 
 
 		 823 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2869  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.63 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.32 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.06 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.06 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3698  ABC transporter related  42.98 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  43.97 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  42.49 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  43.97 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  43.97 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  42.49 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  42.49 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2790  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  42.8 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  41.44 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  48.26 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  42.06 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  47.79 
 
 		 823 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1798  ABC transporter related  42.54 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.669226  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  44.02 
 
 		 246 aa  187  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  48.07 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  44.78 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>