More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2990 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5903  ABC transporter related  53.04 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.32 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0055  ABC transporter related  51.87 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4425  ABC transporter related  49.14 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5698  ABC transporter related  48.03 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.107636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6651  ABC transporter related  47.41 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653804  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  39.17 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  45.37 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  45.58 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.3 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1048  ABC transporter related  46.89 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.3 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  37.99 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  37.39 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.57 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  39.57 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.04 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  39.57 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.17 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  42.52 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.65 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.23 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  39.57 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  39.06 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  39.35 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.83 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  38.91 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  39.13 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.21 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.13 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.74 
 
 		 252 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1099  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.91 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.09 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.21 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  36.96 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.92 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  35.06 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.56 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0990  ABC transporter related  38.39 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.39491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  39.06 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  40.17 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  40.17 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.87 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3687  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.05 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1252  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.86 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.56 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.34 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  44.7 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1771  ABC transporter related  37.83 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  40.52 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1182  ABC transporter related  41.18 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  35.06 
 
 		 232 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  41.4 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  38.5 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0950  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.86 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.39 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  36.52 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  38.21 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  42.45 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0956  ABC transporter-related protein  37.91 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187154  normal  0.0788319 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 231 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  40.65 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1001  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.44 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284976  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  42.06 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  40.85 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.81 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  42.52 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  41.67 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.52 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.85 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  37.44 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4365  ABC transporter-like  39.09 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  39.25 
 
 		 239 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  36.96 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.51 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  37.5 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00885  putative branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, ATP_bind)  34.91 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  41.31 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  39.11 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  37.07 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>