More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2917 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  48.44 
 
 		 555 aa  222  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  46.35 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  43.64 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  43.72 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  42.31 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 289 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  46.41 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 290 aa  201  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 286 aa  201  8e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  42.6 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  45.54 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  40.77 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  41.74 
 
 		 277 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  36.75 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  43.11 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  43.4 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  40.87 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.56 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  39.06 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  40.6 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  37.87 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  41.3 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  41 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  40.6 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  42.13 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  39.74 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  40.85 
 
 		 237 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  42.06 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  41.95 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  39.22 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  39.32 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  40.34 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  38.2 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  38.72 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  39.06 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.53 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  41.45 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  42.06 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  41.88 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  41.22 
 
 		 252 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  40.17 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  40 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  40.25 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.63 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.34 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  39.06 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  44.87 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  39.32 
 
 		 235 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  40.17 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  39.32 
 
 		 239 aa  187  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  36.02 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.86 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  41.7 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  38.86 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  40.82 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0008  ABC transporter related  42.24 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419449  hitchhiker  0.000235622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  43.1 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  41.28 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  38.75 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4056  ABC transporter related  40.16 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  36.86 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  36.13 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  42.31 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  40.43 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  40.34 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  40.85 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  39.91 
 
 		 236 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  40.34 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  38.87 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  41.1 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3056  ABC transporter related  39.13 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  39.06 
 
 		 233 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  41.63 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  38.2 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  37.45 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  37.87 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>