More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4425 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4425  ABC transporter related  100 
 
 		 243 aa  470  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6651  ABC transporter related  62.61 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653804  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5698  ABC transporter related  61.3 
 
 		 235 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.107636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.52 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0055  ABC transporter related  52 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5903  ABC transporter related  50.85 
 
 		 235 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  50.71 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  47.47 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  48.85 
 
 		 235 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  45.37 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  42.36 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  43.93 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  42.24 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  41.41 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  40.85 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  44.24 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2486  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.82 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.72 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  43.52 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2888  high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC transporter ATP-binding protein)  42.4 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.0641084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0427  ABC transporter related  41.67 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0906  ABC transporter related  41.67 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1500  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.45 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3131  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3071  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3107  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.168461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4010  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.36 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00833524  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  41.92 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  42.79 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  43.84 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  41.28 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0876  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.67 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0840  ABC transporter related  39.32 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.206601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1851  ABC transporter related  41.48 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0531443  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.69 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  45.75 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  41.74 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  39.17 
 
 		 233 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  44.55 
 
 		 234 aa  164  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3498  ABC transporter related  43.42 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1661  ABC transporter related  41.05 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  41.47 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  41.94 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  41.03 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0794  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  41.48 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  42.04 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  42.04 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  37.89 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  38.94 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  39.04 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0783  ABC transporter related  39.55 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1466  ABC transporter-like protein  45.54 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  41.52 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  40.18 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  42.99 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  39.63 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  42.92 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  39.83 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  40.55 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  43.12 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  43.06 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  39.66 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2946  ABC transporter related  42.99 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  38.91 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  42.66 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  41.51 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.38 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  44.64 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  41.78 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  42.22 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  41.78 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  41.78 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  37.83 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  37.07 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  44.24 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1287  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.99 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  42.53 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  42.24 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2791  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889429  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  40.64 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  43.86 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  40.09 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  38.79 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  40.19 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  41.4 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  38.26 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2309  ABC transporter related  38.36 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2528  ABC transporter related  43.93 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.53065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>