More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0055 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0055  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.57 
 
 
235 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5903  ABC transporter related  55.87 
 
 
235 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4425  ABC transporter related  52 
 
 
243 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5698  ABC transporter related  49.57 
 
 
235 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.107636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  51.64 
 
 
233 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6651  ABC transporter related  49.33 
 
 
235 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653804  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  45.49 
 
 
246 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  44.44 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  44.64 
 
 
248 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  46.95 
 
 
247 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  43.97 
 
 
251 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  44.49 
 
 
254 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  44.21 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  44.21 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  44.59 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  44.02 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.69 
 
 
248 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.69 
 
 
248 aa  182  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  45.54 
 
 
246 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  41.56 
 
 
230 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  43.97 
 
 
251 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  42.49 
 
 
234 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  44.76 
 
 
240 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.48 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  42.24 
 
 
237 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.29 
 
 
231 aa  178  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.53 
 
 
248 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  42.29 
 
 
230 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 
233 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 
230 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.07 
 
 
247 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  44.44 
 
 
232 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  42.92 
 
 
239 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  44.5 
 
 
231 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  40.87 
 
 
229 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  41.26 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  41.99 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  42.42 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  45.19 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  41.3 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.77 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  42.29 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  43.81 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  44.6 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.56 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.912027  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  41.98 
 
 
241 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 
229 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  42.2 
 
 
241 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  45.79 
 
 
232 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  41.63 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.85 
 
 
230 aa  171  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  44.55 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.43 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 
232 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  41.63 
 
 
243 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.83 
 
 
229 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  41.7 
 
 
230 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  41.42 
 
 
237 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  45.79 
 
 
232 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
243 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  39.11 
 
 
229 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  40.43 
 
 
229 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
237 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  41.13 
 
 
234 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.7 
 
 
230 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  42.4 
 
 
239 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  41.56 
 
 
230 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  41.98 
 
 
241 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.82 
 
 
232 aa  168  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3496  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 
234 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124026  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  39.22 
 
 
242 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  42.33 
 
 
237 aa  168  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
240 aa  168  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  43.46 
 
 
236 aa  168  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  39.01 
 
 
230 aa  168  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  43.58 
 
 
234 aa  168  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  43.58 
 
 
234 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.64 
 
 
232 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  42.6 
 
 
246 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.78 
 
 
232 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  43.18 
 
 
232 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.57 
 
 
230 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  39.11 
 
 
229 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.57 
 
 
230 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.1 
 
 
252 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  39.83 
 
 
234 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  43.64 
 
 
232 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4008  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.65 
 
 
230 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  42.66 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.05 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1002  ABC transporter related  42.01 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  42.25 
 
 
233 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>