More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1001 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1001  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284976  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  46.35 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.92 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  48.52 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  48.1 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.93 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  46.26 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  47.68 
 
 		 247 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  47.86 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0575  ABC transporter related  47.84 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  43.93 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  42.31 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  43.7 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  45.11 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  44.77 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.26 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  44.89 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.29 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  46.88 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  45.99 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  43.17 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  44.77 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  44 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.68 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  45.85 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  47.11 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  46.85 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  44.44 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  44.92 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  44.26 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  41.42 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  42.62 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  42.26 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  42.26 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  45.96 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  45.38 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  43.4 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  44.78 
 
 		 830 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0223  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.52 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0851652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  46.29 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  43.16 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  45.81 
 
 		 822 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  44.68 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  43.64 
 
 		 265 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  41.42 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  44.87 
 
 		 823 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  43.15 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  41.74 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  44.25 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  45.8 
 
 		 247 aa  191  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  43.51 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  43.97 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  42.8 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  42.44 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  42.44 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  45.7 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  43.04 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1782  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  47.41 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00215494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  44.74 
 
 		 253 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  45.96 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  46.19 
 
 		 437 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7077  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  44.02 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  42.06 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  44.78 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  45 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  44.54 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  43.11 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  44.25 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>