More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1307 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5903  ABC transporter related  79.57 
 
 		 235 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0055  ABC transporter related  53.57 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4425  ABC transporter related  51.52 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6651  ABC transporter related  51.29 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653804  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5698  ABC transporter related  50.86 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.107636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  44.21 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  40.77 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1048  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  43.23 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  40.17 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  43.58 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.63 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3207  ABC transporter related  41.82 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.36 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  43.5 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.6 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  42.29 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  40.09 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  38.71 
 
 		 234 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  37.61 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  36.29 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0980  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.39 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  38.18 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.69 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  40.97 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  40.65 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  42.52 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  40.81 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  40.65 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  42.73 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1397  ABC transporter related  40.45 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.37 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  41.41 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4609  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.64 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258577  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4637  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.36 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4845  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.59 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.15471  normal  0.225038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.93 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  40.53 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.46 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  39.82 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  40.53 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  38.64 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  39.92 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.37 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.46 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0353  amidase  42.99 
 
 		 793 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484416  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3860  ABC transporter related  39.57 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.7 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  41.28 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0990  ABC transporter related  39.19 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  39.18 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4723  ABC transporter related  41.12 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.73 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4111  ABC transporter related  41.81 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  37.23 
 
 		 229 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  39.81 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  42.2 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  40.09 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  41.78 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  41.9 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  39.18 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  38.63 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.63 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.43 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1001  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.99 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284976  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  39.57 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  38.36 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.91 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4902  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.65 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24992  normal  0.0123469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.29 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2616  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.01 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  normal  0.0878599 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  39.37 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  42.13 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  37.87 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.15 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1707  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.91 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00153599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  39.91 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  39.37 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1992  ABC transporter related  38.57 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17917  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  39.91 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  39.37 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  36.71 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1447  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.98 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  41.33 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  42.2 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  41.1 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2742  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.7 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  38.7 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  42.45 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>