More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1048 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1048  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  90.56 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1252  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  55.95 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  49.1 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  50.9 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  42.98 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  42.73 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  46.93 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  41.52 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.79 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0704  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  46.95 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000400614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  45.69 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  38.53 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2717  ABC transporter related  45.18 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.54 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  41.85 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3802  ABC transporter related  45.07 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2013  ABC transporter related  41.41 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.72 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  44.92 
 
 		 250 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  40.27 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  44.83 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  41.96 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.08 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2592  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  42.36 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  43.48 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  41.59 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  42.17 
 
 		 280 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  37.39 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  37.33 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2326  ABC transporter related  43.66 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.0685301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  39.82 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2287  ABC transporter related  43.66 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  41.52 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2334  ABC transporter related  43.66 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  43.56 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  41.92 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0040  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0383102  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  39.65 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.12 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  43.48 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  41.15 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.44 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  37.17 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.08 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  39.91 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  42.6 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  41.1 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.67 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  40.18 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  40.71 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  42.22 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  40.71 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.92 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  43.48 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.15 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  41.92 
 
 		 828 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  40.71 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  39.19 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  41.82 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.54 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  43.58 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  40.71 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  39.24 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.77 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  43.05 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  41.07 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  40.27 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  42.22 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0215  ABC transporter related  42.79 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.11 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  40.71 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  42.6 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  41.2 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  42.04 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  42.6 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  40.17 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.06 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0912  ABC transporter related  42.06 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  41.89 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  40.34 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0083  ABC transporter related  40.34 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>