More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3664 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3664  ABC transporter component  100 
 
 		 230 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  48.93 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.98 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  49.16 
 
 		 259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  48.74 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  45.69 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  45.92 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.06 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.06 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.21 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  45.8 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  49.57 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  43.97 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  42.44 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.53 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  47.39 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  45.38 
 
 		 536 aa  188  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  43.23 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  45.11 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  43.67 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  43.35 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.48 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  45.85 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 		 234 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  39.3 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  41.81 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  41.81 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  43.04 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  43.04 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  43.04 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  44.59 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  40.72 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  46.32 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.74 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  43.29 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  46.32 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.48 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  45.26 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  45.65 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  42.49 
 
 		 233 aa  177  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  39.01 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  41.3 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  44.83 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.77 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  44.21 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  41.74 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  40.52 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  45.02 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  41.2 
 
 		 235 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  40 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  43.23 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2560  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.390131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.84 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 256 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  40.87 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1285  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.77 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  42.19 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2667  ABC transporter related  42.11 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  41.81 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  39.64 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.62 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1827  putative branched amino acid related transport system protein  48.15 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1651  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1673  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  39.66 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  43.29 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  39.62 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.69 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  39.62 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  40.87 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  38.96 
 
 		 229 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  39.22 
 
 		 236 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  40.87 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.96 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.1 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  42.53 
 
 		 245 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  42.92 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  40.61 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  38.89 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  39.13 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>