More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5698 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5698  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.107636  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6651  ABC transporter related  93.62 
 
 
235 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653804  normal  0.0349153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4425  ABC transporter related  61.3 
 
 
243 aa  276  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5903  ABC transporter related  51.3 
 
 
235 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451003  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.86 
 
 
235 aa  222  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0055  ABC transporter related  49.57 
 
 
233 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  48.03 
 
 
233 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
232 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  45.87 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  45.61 
 
 
235 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  43.33 
 
 
235 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  43.58 
 
 
235 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  44.2 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.87 
 
 
248 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.87 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4098  ABC transporter related  45.37 
 
 
286 aa  170  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  37.99 
 
 
229 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  42.18 
 
 
233 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
237 aa  169  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1593  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.57 
 
 
229 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  42.86 
 
 
241 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.02 
 
 
250 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  38.86 
 
 
229 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  42.13 
 
 
233 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  38.86 
 
 
229 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  48.82 
 
 
235 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  38.86 
 
 
229 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  41.01 
 
 
247 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.27 
 
 
254 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  41.13 
 
 
251 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.62 
 
 
229 aa  167  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  41.05 
 
 
237 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.86 
 
 
229 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.72 
 
 
234 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3502  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.45 
 
 
251 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427588  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1001  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 
238 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284976  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  43.19 
 
 
244 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  41.96 
 
 
241 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  43.4 
 
 
256 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  44.08 
 
 
237 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  43.19 
 
 
243 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1782  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  43.38 
 
 
241 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00215494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  42.79 
 
 
246 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  41.94 
 
 
237 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  42.18 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  38.86 
 
 
229 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2084  ABC transporter related  45.5 
 
 
245 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.4 
 
 
234 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  40.64 
 
 
236 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  41.51 
 
 
242 aa  165  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.03 
 
 
247 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  42.13 
 
 
239 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.77 
 
 
252 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  41.48 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  41.13 
 
 
236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
234 aa  164  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  38.65 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2255  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.23 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  43.81 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  41.04 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  38.43 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  47.39 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  42.99 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  43.13 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1256  ABC transporter related  35.93 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.07 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  41.23 
 
 
233 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 
229 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
234 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
235 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  44.44 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  40.76 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  41.98 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  41.01 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  40.76 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  41.4 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  41.28 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  39.56 
 
 
240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  42.45 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0224  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  37.12 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  40.77 
 
 
238 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
236 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2180  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.23 
 
 
230 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.32 
 
 
229 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  40.76 
 
 
233 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  41.51 
 
 
235 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2052  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
230 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2561  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
230 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  40.77 
 
 
238 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  39.63 
 
 
249 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  40.28 
 
 
237 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  40.28 
 
 
237 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0728  putative amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.23 
 
 
230 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1941  ABC transporter related  37.83 
 
 
232 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.174596  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>