More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4484 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4484  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4565  ABC transporter related  49.15 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  51.48 
 
 		 822 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  50.43 
 
 		 538 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  43.88 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  48.94 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  50.63 
 
 		 823 aa  194  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.81 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  50.63 
 
 		 823 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  49.17 
 
 		 827 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  47.86 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  48.12 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  44.96 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  49.15 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  43.28 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  42.19 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  46.35 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.19 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  42.19 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  46.19 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  46.03 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  46.38 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  46.03 
 
 		 832 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  44.35 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  47.23 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2118  ABC transporter related  45.19 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6492  ABC transporter related  46.06 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0130202  normal  0.104437 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  42.02 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  45.53 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  45.04 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  44.78 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  47.11 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  46.67 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  42.31 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  44.87 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  43.27 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  46.19 
 
 		 265 aa  181  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  44.17 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.35 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  44.21 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  46.84 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  49.78 
 
 		 1302 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  45.06 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.28 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.67 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  44.64 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  42.86 
 
 		 238 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  42.26 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  44.87 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  42.98 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  46.15 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  45.34 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  43.28 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  44.35 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  46.55 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  45.34 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1176  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128405  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  44.81 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  45.3 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  46.25 
 
 		 830 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  44.54 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.3 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  39.43 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3858  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  41.45 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  44.77 
 
 		 244 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  40.77 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  41.42 
 
 		 256 aa  177  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>