More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1702 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  100 
 
 
267 aa  535  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  82.99 
 
 
242 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  79.67 
 
 
242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  81.67 
 
 
243 aa  401  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  44.77 
 
 
233 aa  208  8e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  45.61 
 
 
233 aa  206  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  46.86 
 
 
234 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  43.98 
 
 
237 aa  198  6e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  46.03 
 
 
233 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  46.03 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  43.15 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  45.37 
 
 
240 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  45.61 
 
 
233 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  45.61 
 
 
233 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  44.63 
 
 
235 aa  193  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  44.35 
 
 
233 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  46.03 
 
 
233 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  46.03 
 
 
233 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
247 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  45.34 
 
 
257 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  45.61 
 
 
233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  45.61 
 
 
233 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.61 
 
 
233 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
233 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
247 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  47.21 
 
 
244 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
233 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.32 
 
 
243 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  44.77 
 
 
233 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1952  ABC transporter related  45.69 
 
 
234 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.571715  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  45.19 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.89 
 
 
234 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  46.72 
 
 
244 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  43.57 
 
 
239 aa  188  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  42.23 
 
 
256 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  46.58 
 
 
246 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.49 
 
 
247 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  44.17 
 
 
235 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  44.77 
 
 
258 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  44.78 
 
 
248 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  44.63 
 
 
236 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
233 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  43.78 
 
 
239 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1743  ABC transporter related  44.35 
 
 
258 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
248 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  45.49 
 
 
254 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3512  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.78 
 
 
243 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  45.54 
 
 
247 aa  186  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.19 
 
 
235 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  44.93 
 
 
244 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  44.81 
 
 
234 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  44.93 
 
 
238 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  43.62 
 
 
247 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  43.33 
 
 
238 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  43.51 
 
 
234 aa  186  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2394  ABC transporter related  44.93 
 
 
241 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805678  normal  0.040758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  44.21 
 
 
235 aa  185  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  46.29 
 
 
246 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5433  ABC transporter related  44.35 
 
 
258 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3069  ABC transporter related  44.05 
 
 
247 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.986829  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  43.29 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  45 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  43.78 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  45.53 
 
 
237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  44.35 
 
 
234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
235 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  43.57 
 
 
233 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  46.35 
 
 
294 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  43.53 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  42.68 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3325  ABC transporter related  43.61 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  44.07 
 
 
238 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  43.29 
 
 
234 aa  182  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  43.35 
 
 
238 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  42.26 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  41.28 
 
 
247 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.41 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  42.08 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  41.3 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3616  ABC transporter related  43.97 
 
 
234 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  42.15 
 
 
238 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  43.33 
 
 
236 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  42.49 
 
 
236 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  42.92 
 
 
236 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  43.29 
 
 
235 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 
235 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  43.21 
 
 
245 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  42.5 
 
 
243 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  42.08 
 
 
237 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  43.51 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45 
 
 
234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  45.61 
 
 
233 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  41.84 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  43.33 
 
 
236 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1137  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
233 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1171  ABC transporter related  42.68 
 
 
233 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>