More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1807 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  100 
 
 
233 aa  462  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  83.19 
 
 
234 aa  393  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  67.67 
 
 
233 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  62.66 
 
 
235 aa  289  3e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  49.37 
 
 
243 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  47.7 
 
 
242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  46.86 
 
 
242 aa  207  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  45.61 
 
 
267 aa  206  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  46.38 
 
 
238 aa  206  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  40.17 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  40.77 
 
 
247 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  39.48 
 
 
234 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1489  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
251 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  37.99 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  39.32 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  40.6 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  38.86 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  38.57 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  37.12 
 
 
237 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  40.09 
 
 
233 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.67 
 
 
234 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  43.75 
 
 
239 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  43.75 
 
 
239 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  43.75 
 
 
239 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  38.89 
 
 
244 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  42.74 
 
 
233 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  42.92 
 
 
239 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  38.72 
 
 
239 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
233 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.87 
 
 
280 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
233 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  39.91 
 
 
237 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
233 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
290 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
279 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  39.22 
 
 
233 aa  168  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  42.24 
 
 
235 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1115  ABC transporter related  39.66 
 
 
248 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000583905  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1722  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
248 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.86 
 
 
240 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  38.7 
 
 
236 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
235 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.7 
 
 
236 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  38.82 
 
 
238 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  39.57 
 
 
234 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  39.48 
 
 
256 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  40 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  41.38 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  38.16 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  40.52 
 
 
271 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.17 
 
 
231 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
286 aa  165  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4333  ABC transporter related  41.28 
 
 
246 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  39.51 
 
 
242 aa  165  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  39.48 
 
 
257 aa  164  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  41.2 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  41.63 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  37.77 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  38.2 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  40.95 
 
 
823 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.93 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  39.65 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  38.26 
 
 
241 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  41.88 
 
 
246 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  38.03 
 
 
237 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  41.35 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  37.93 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  40.43 
 
 
250 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1748  ABC transporter component  38.79 
 
 
240 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.644006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  35.93 
 
 
238 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3903  ABC transporter related  40.09 
 
 
257 aa  162  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.784547  normal  0.979503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0777  ABC transporter related  40.52 
 
 
241 aa  161  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  36.32 
 
 
236 aa  161  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.63 
 
 
254 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  37.07 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  39.22 
 
 
244 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  37.18 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3257  ABC transporter related  37.93 
 
 
237 aa  161  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578651  normal  0.0886987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2610  ABC transporter related  37.93 
 
 
237 aa  161  9e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.132263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  40.09 
 
 
233 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  40.17 
 
 
252 aa  161  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
245 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  40.93 
 
 
254 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  41.45 
 
 
244 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  38.03 
 
 
233 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
237 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 
237 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 
237 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  36.99 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 
233 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  39.15 
 
 
249 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  40.52 
 
 
823 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>