More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0777 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0777  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  473  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2201  ABC transporter related  49.13 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  37.45 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3249  ABC transporter related  41.84 
 
 		 749 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  41.08 
 
 		 748 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  41.88 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  41.81 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  39.74 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  33.62 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3153  ABC transporter related  40.83 
 
 		 803 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  39.06 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  38.1 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  37.34 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  39.39 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0314  ABC transporter related  43.06 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  39.83 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.71 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  38.98 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  38.91 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3369  ABC transporter related  40.34 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  41.05 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3770  ABC transporter related  40.34 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  35.9 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  38.98 
 
 		 240 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  35.34 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  36.48 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  40.52 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0215  ABC transporter related  45 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  39.48 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  35.78 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  34.48 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  36.05 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  35.86 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  35.86 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  35.86 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  38.63 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  36.32 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1782  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  41.77 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00215494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  41.03 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  35.17 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2252  ABC transporter related  38.66 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.54606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  37.45 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  35.74 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.08 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1393  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  39.39 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  36.02 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  36.05 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  38.49 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  35.9 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  37.86 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  41.88 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  36.05 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  37.93 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1425  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0964175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0475  ABC transporter related  36.36 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  43.39 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  35.62 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  35.9 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  40.6 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  39.65 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1498  ABC transporter related  36.05 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  38.89 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  35.34 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  35.62 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  37.04 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  41.63 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  38.2 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  37.02 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  38.98 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  36.71 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0676  ABC transporter related  38.03 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  37.5 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  37.45 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  36.51 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  38.53 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  34.6 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  36.48 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1294  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  39.83 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1619  ABC transporter related  38.84 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  38.82 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>