More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3191 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3249  ABC transporter related  80.57 
 
 		 749 aa  1163    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3153  ABC transporter related  88.4 
 
 		 803 aa  1269    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  100 
 
 		 748 aa  1469    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  44.02 
 
 		 234 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  43.16 
 
 		 235 aa  194  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 237 aa  193  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7593  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.87 
 
 		 240 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  44.92 
 
 		 235 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  44.44 
 
 		 238 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.59 
 
 		 234 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  43.83 
 
 		 235 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 236 aa  191  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  43.59 
 
 		 235 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 235 aa  191  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 237 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 237 aa  189  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  42.62 
 
 		 237 aa  188  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2503  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 235 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  44.76 
 
 		 863 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  42.74 
 
 		 234 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  44.92 
 
 		 234 aa  187  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  42.37 
 
 		 254 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  42.37 
 
 		 254 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  43.83 
 
 		 247 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  43.83 
 
 		 247 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  42.37 
 
 		 254 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  43.83 
 
 		 247 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2281  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  185  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  41.88 
 
 		 233 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 		 234 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.37 
 
 		 254 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  42.31 
 
 		 233 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.6 
 
 		 236 aa  183  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  40.08 
 
 		 236 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  40.5 
 
 		 260 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3818  ABC transporter related  41.53 
 
 		 253 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0166098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  42.62 
 
 		 237 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 234 aa  182  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 259 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  43.21 
 
 		 253 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  38.4 
 
 		 236 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  41.88 
 
 		 239 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  42.98 
 
 		 234 aa  182  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  42.21 
 
 		 247 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  43.59 
 
 		 240 aa  180  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  39.74 
 
 		 237 aa  180  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  42.92 
 
 		 246 aa  180  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  41.03 
 
 		 234 aa  180  9e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  42.74 
 
 		 240 aa  180  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  41.03 
 
 		 236 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  41.28 
 
 		 233 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.37 
 
 		 262 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 233 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 238 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 235 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 245 aa  178  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  41.53 
 
 		 254 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  42.32 
 
 		 240 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  41.95 
 
 		 238 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  42.67 
 
 		 838 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4102  ABC transporter related  43.93 
 
 		 249 aa  178  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  41.95 
 
 		 238 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  41.77 
 
 		 237 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.17 
 
 		 234 aa  177  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  42.56 
 
 		 240 aa  177  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 234 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  45.11 
 
 		 237 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  40.08 
 
 		 235 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4063  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.28 
 
 		 234 aa  176  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 238 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  41.7 
 
 		 238 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2169  ABC transporter related  41.88 
 
 		 235 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  39.92 
 
 		 239 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  40 
 
 		 243 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  40.6 
 
 		 244 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  42.41 
 
 		 233 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 238 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  43.64 
 
 		 254 aa  175  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 		 233 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  37.18 
 
 		 238 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 233 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  40.76 
 
 		 238 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  40.6 
 
 		 233 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 237 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 237 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 237 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 237 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  36.55 
 
 		 238 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  40.68 
 
 		 238 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  41.95 
 
 		 241 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.6 
 
 		 237 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  36.6 
 
 		 238 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  40.17 
 
 		 236 aa  174  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  43.88 
 
 		 234 aa  174  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  41.88 
 
 		 238 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  41.53 
 
 		 238 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  41.67 
 
 		 247 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>