More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4063 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4063  ABC transporter related  100 
 
 
258 aa  510  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3770  ABC transporter related  73.75 
 
 
245 aa  362  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.463504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3369  ABC transporter related  72.92 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581265  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  48.54 
 
 
239 aa  224  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  48.94 
 
 
234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  44.44 
 
 
254 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
234 aa  216  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  49.37 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1138  ABC transporter related  45.96 
 
 
234 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.113733 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  47.11 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.13 
 
 
254 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2267  ABC transporter related  48.95 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00164993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  43.48 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  44.05 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  44.63 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  47.01 
 
 
832 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  47.46 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26090  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  45.53 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  45.96 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  45.34 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  47.7 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1325  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 
243 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0593111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  48.31 
 
 
236 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  45.64 
 
 
251 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  47.68 
 
 
238 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  46 
 
 
270 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0695  ABC transporter related  47.15 
 
 
252 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.321828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  43.4 
 
 
234 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  46.61 
 
 
234 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  44.58 
 
 
250 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  45.53 
 
 
234 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  44.68 
 
 
239 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
237 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
245 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.53 
 
 
239 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.87 
 
 
254 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  44.3 
 
 
242 aa  208  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5638  ABC transporter related  45.38 
 
 
239 aa  208  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 
235 aa  208  7e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  43.62 
 
 
254 aa  208  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  46.81 
 
 
234 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  47.26 
 
 
235 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  46.22 
 
 
239 aa  208  8e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  44.31 
 
 
830 aa  208  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  43.1 
 
 
238 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1102  ABC transporter related  45.76 
 
 
235 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.0079799  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3649  ABC transporter related  45.99 
 
 
243 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.5266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  42.92 
 
 
247 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  42.92 
 
 
247 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  44.07 
 
 
235 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
234 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
251 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  42.92 
 
 
247 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.23 
 
 
239 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  45.11 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  46.81 
 
 
241 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.34 
 
 
234 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  47.88 
 
 
242 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  44.44 
 
 
251 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.34 
 
 
251 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  46.81 
 
 
241 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  48.94 
 
 
249 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 
234 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
234 aa  205  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  45.34 
 
 
238 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  43.4 
 
 
234 aa  205  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0335  ABC transporter related  46 
 
 
249 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  45.99 
 
 
234 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  44.73 
 
 
236 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
251 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
237 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1393  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
236 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  43.04 
 
 
240 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.38 
 
 
239 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  45.11 
 
 
243 aa  203  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1197  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
242 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2943  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
251 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  44.68 
 
 
238 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  43.04 
 
 
240 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  44.26 
 
 
238 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1600  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
252 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3002  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
251 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
247 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  44.26 
 
 
236 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3368  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
251 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  47.88 
 
 
237 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.68 
 
 
234 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  44.26 
 
 
238 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0093  ABC transporter related  44.26 
 
 
252 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899173  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  45.53 
 
 
233 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1099  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 
242 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  43.04 
 
 
240 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  44.92 
 
 
237 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.2 
 
 
251 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  42.28 
 
 
247 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  48.31 
 
 
236 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  45.12 
 
 
247 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  45.12 
 
 
247 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>