More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0823 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0823  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  472  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1501  ABC transporter related  74.57 
 
 
233 aa  347  8e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.196054  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0314  ABC transporter related  63.79 
 
 
234 aa  299  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  62.66 
 
 
233 aa  289  3e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  47.23 
 
 
238 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0503  ABC transporter related  42.49 
 
 
242 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.372423 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1774  ABC transporter related  43.35 
 
 
243 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000270769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  40.53 
 
 
237 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1702  ABC transporter related  39.26 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.411618 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.69 
 
 
277 aa  171  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  38.3 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  38.1 
 
 
236 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.73 
 
 
254 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  41.99 
 
 
254 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1586  ABC transporter related  38.91 
 
 
242 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  41.56 
 
 
254 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  39.39 
 
 
234 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  41.03 
 
 
235 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3934  ABC transporter related  41.56 
 
 
254 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  39.57 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.17 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  37.99 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5099  ABC transporter related  40.69 
 
 
254 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23505  normal  0.121092 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
234 aa  161  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
289 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
243 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  37.89 
 
 
555 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  39.48 
 
 
247 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  43.06 
 
 
237 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.72 
 
 
236 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1489  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
251 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  37.72 
 
 
236 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  42.73 
 
 
484 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  37.61 
 
 
249 aa  158  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  40.26 
 
 
234 aa  158  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  38.3 
 
 
233 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0504  ABC transporter related  39.83 
 
 
254 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  40.85 
 
 
243 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  37.29 
 
 
236 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  37.83 
 
 
241 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  38.3 
 
 
284 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  40.09 
 
 
271 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  36.17 
 
 
234 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0844  ABC transporter related  38.53 
 
 
234 aa  155  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
290 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  36.05 
 
 
240 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4793  ABC transporter related  35.74 
 
 
233 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.262545  normal  0.126622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  39.66 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  40 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  39.15 
 
 
239 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
234 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1852  ABC transporter related  38.39 
 
 
256 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231349  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  40.09 
 
 
245 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  35.47 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  39.13 
 
 
276 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
235 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  36.75 
 
 
241 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  36.8 
 
 
234 aa  152  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0704  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.93 
 
 
230 aa  152  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000400614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  39.32 
 
 
235 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
245 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3191  ABC transporter related  38.43 
 
 
748 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
240 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  35.74 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0777  ABC transporter related  35.74 
 
 
241 aa  150  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
235 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2137  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
251 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0427504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0889  ABC transporter related  35.74 
 
 
233 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  37.02 
 
 
238 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
238 aa  149  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
235 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  35.59 
 
 
234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  38.2 
 
 
242 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
235 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  38.4 
 
 
286 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1393  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
236 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5600  ABC transporter related protein  35.04 
 
 
235 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0594  ABC transporter related  33.33 
 
 
236 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.89 
 
 
234 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  39.48 
 
 
242 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3249  ABC transporter related  37.99 
 
 
749 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  39.08 
 
 
239 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
237 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  32.63 
 
 
234 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0529  ABC transporter related  39.83 
 
 
240 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000281948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  36.02 
 
 
243 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  33.76 
 
 
242 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  35.86 
 
 
249 aa  148  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  36 
 
 
235 aa  148  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
236 aa  148  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3326  ABC transporter related  35.34 
 
 
244 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
233 aa  148  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  36.05 
 
 
256 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  36.4 
 
 
244 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  35.74 
 
 
231 aa  148  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  36.73 
 
 
238 aa  148  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3690  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 
249 aa  148  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  34.47 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>