More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6114 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6114  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579004  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3690  ABC transporter-related protein  51.88 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1852  ABC transporter related  50.21 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231349  normal  0.204249 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1654  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  241  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.611887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  45.11 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  41.6 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  40.76 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.76 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  41.84 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  42.02 
 
 		 236 aa  204  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  41.77 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.88 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3518  ABC transporter related  40.34 
 
 		 240 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  41.6 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0609  ABC transporter related  40.34 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0910  ABC transporter related  43.75 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.175671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1426  ABC transporter related  41.77 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  41.88 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0672  ABC transporter related  43.83 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  40.6 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  39.33 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  40.08 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.6 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1908  ABC transporter related  42.06 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.240732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.08 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  40.6 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  39.75 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1654  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 243 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10025  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0338  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  40.59 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  40.34 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  40.17 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  37.61 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  40.6 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  39.83 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  39.5 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  40.17 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  40.6 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  39.08 
 
 		 240 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  39.32 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  40.25 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3332  ABC transporter related  39.22 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  39.32 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  40.17 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  41.45 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1976  ABC transporter related  42.02 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  39.91 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  43.88 
 
 		 242 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2492  ATPase  40.51 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3502  ABC transporter related  39.15 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  38.49 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  42.08 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0778  ABC transporter related  41.6 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  42.06 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3835  ABC transporter related  39.74 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.554718  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  40.76 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  41.03 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  40.5 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  41.22 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  39.42 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3751  ABC transporter related  39.48 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3361  ABC transporter related  39.5 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280372  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  37.18 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  40.68 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.97 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.97 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.97 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  38.46 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  40.93 
 
 		 832 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.97 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.97 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  39.33 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0191  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.148253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  38.2 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4057  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4631  ABC transporter related  41.18 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3040  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  37.82 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3983  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  38.84 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  40.66 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  41.18 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.25 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3709  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.86 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 		 237 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  42.08 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  42.08 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>