284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4056 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
580 aa  1114    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  56.05 
 
 
545 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 
531 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  56.97 
 
 
534 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  55.25 
 
 
560 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  51.49 
 
 
530 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  58.11 
 
 
530 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 
526 aa  475  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  56.57 
 
 
534 aa  475  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 
530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  50.93 
 
 
530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  52.67 
 
 
528 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  49.5 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 
524 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
487 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
506 aa  250  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 
523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
474 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
474 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  36.45 
 
 
515 aa  241  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  35.4 
 
 
465 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 
474 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
474 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
505 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  35.98 
 
 
472 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
474 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  34.62 
 
 
470 aa  230  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  32.57 
 
 
476 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  39 
 
 
469 aa  221  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
484 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  34.91 
 
 
473 aa  213  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
469 aa  213  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  33.85 
 
 
472 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
476 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
476 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
556 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
564 aa  211  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
477 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.28 
 
 
511 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
533 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
565 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
466 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
522 aa  194  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
523 aa  193  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 
484 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
547 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  31.71 
 
 
535 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
531 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
561 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
531 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  32.04 
 
 
479 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
491 aa  182  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.99 
 
 
503 aa  182  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  34.04 
 
 
482 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 
468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
563 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.4 
 
 
477 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
559 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.65 
 
 
499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
554 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
547 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.37 
 
 
496 aa  160  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  31.98 
 
 
480 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
491 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
528 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 
536 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  31.17 
 
 
482 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.65 
 
 
527 aa  144  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 
539 aa  144  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
510 aa  144  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.04 
 
 
530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  30.58 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  32.16 
 
 
437 aa  140  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.73 
 
 
529 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.19 
 
 
532 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  30.92 
 
 
476 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.01 
 
 
532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.9 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  30.92 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  30.92 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
532 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.8 
 
 
533 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
549 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
535 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
536 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
552 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.85 
 
 
530 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 
516 aa  116  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  31.83 
 
 
545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>