More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3085 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  99.25 
 
 
530 aa  1051    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
530 aa  1056    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
530 aa  1056    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  59.88 
 
 
528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  52.73 
 
 
531 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  54.47 
 
 
545 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  52.02 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  52.72 
 
 
534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  49.61 
 
 
528 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  50.2 
 
 
526 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
580 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
560 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  49.9 
 
 
530 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
524 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
474 aa  259  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 
474 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
487 aa  258  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  38.02 
 
 
481 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  34.12 
 
 
470 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
506 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  34 
 
 
465 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
476 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  35.32 
 
 
472 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
515 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  31.03 
 
 
476 aa  226  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.95 
 
 
469 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
477 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  33.4 
 
 
473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
478 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
466 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  28.21 
 
 
476 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
469 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
484 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
472 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.46 
 
 
503 aa  199  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
523 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
484 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 
474 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
468 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.87 
 
 
511 aa  192  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
474 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
474 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  33.53 
 
 
482 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
547 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  32.5 
 
 
480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  32.35 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  32.35 
 
 
491 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  32.35 
 
 
491 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.3 
 
 
499 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
491 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
487 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
559 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
563 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
564 aa  177  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
554 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
554 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
565 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.5 
 
 
529 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  29.33 
 
 
479 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 
556 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  30.83 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  30.98 
 
 
482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.42 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
491 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.47 
 
 
496 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  31.57 
 
 
482 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
514 aa  162  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.34 
 
 
556 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
524 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  26.42 
 
 
530 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
531 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.96 
 
 
510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
537 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
533 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
555 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  31.54 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
531 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
533 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
523 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.71 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.22 
 
 
533 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 
535 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 
561 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
536 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
549 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
536 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.2 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 
552 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  30.28 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
547 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>