219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03260 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  988    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  53.22 
 
 
476 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  50.74 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 
476 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 
478 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  49.68 
 
 
474 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 
474 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  49.47 
 
 
484 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 
487 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  46.24 
 
 
470 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  48.08 
 
 
472 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  45.16 
 
 
465 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  41.72 
 
 
515 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
472 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 
505 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 
481 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 
474 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  40.86 
 
 
473 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
474 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  45.11 
 
 
474 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
466 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
468 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 
469 aa  363  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  38.2 
 
 
479 aa  363  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 
491 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  40.26 
 
 
482 aa  353  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  39.57 
 
 
511 aa  349  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.47 
 
 
503 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.34 
 
 
477 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.55 
 
 
469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
491 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  35.2 
 
 
496 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 
524 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  35.58 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 
487 aa  313  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  36.42 
 
 
482 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.45 
 
 
499 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  35.07 
 
 
491 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  35.07 
 
 
491 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  35.07 
 
 
476 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  35.49 
 
 
482 aa  295  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.86 
 
 
545 aa  246  9e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
531 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
528 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
534 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 
568 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  32.26 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 
530 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
530 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 
530 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
560 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
534 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.74 
 
 
530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  24.95 
 
 
535 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  25.05 
 
 
528 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
523 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.13 
 
 
556 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 
554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 
524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
554 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
531 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
555 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.37 
 
 
533 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
523 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
559 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  21.54 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
533 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  23.71 
 
 
523 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  23.52 
 
 
527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
537 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.96 
 
 
563 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 
547 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
537 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
549 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
547 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  23.17 
 
 
510 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 
565 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 
531 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  24.57 
 
 
516 aa  107  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  23.68 
 
 
564 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  23.45 
 
 
527 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  23.99 
 
 
536 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
535 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  24.53 
 
 
532 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  24.67 
 
 
532 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  24.48 
 
 
532 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
518 aa  98.2  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 
536 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.44 
 
 
510 aa  96.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
552 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 
561 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>