More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1963 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  62.62 
 
 
533 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  83.05 
 
 
531 aa  862    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
531 aa  1051    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  58.7 
 
 
523 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  48.86 
 
 
535 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
522 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 
523 aa  319  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
565 aa  203  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
560 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
531 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
564 aa  196  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
563 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
556 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.35 
 
 
545 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
469 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  33.27 
 
 
527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
534 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
474 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  31.47 
 
 
533 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  32.17 
 
 
465 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
537 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
474 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  30.31 
 
 
470 aa  177  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
524 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
536 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 
554 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  30.81 
 
 
472 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
561 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
559 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
554 aa  170  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 
530 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
530 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
530 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 
534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
580 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
547 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
535 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 
487 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
533 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
528 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
537 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
528 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  29.9 
 
 
530 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 
531 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.49 
 
 
530 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
552 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
535 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
547 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
539 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
528 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 
536 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  29.68 
 
 
531 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
506 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
472 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  28.79 
 
 
479 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 
505 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
481 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
510 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
484 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.65 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.68 
 
 
469 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  26.91 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.36 
 
 
556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
514 aa  133  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.79 
 
 
532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
532 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  31.61 
 
 
532 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.41 
 
 
527 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 
532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.37 
 
 
510 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
474 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  23.37 
 
 
476 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 
518 aa  124  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  25.87 
 
 
473 aa  123  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  28.38 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.55 
 
 
499 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
519 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
523 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  26.31 
 
 
496 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.88 
 
 
545 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>