253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1238 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  83.08 
 
 		 470 aa  781    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  100 
 
 		 472 aa  946    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  59.27 
 
 		 487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  55.77 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 477 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  52.24 
 
 		 476 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  54.18 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  52.13 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  50.96 
 
 		 476 aa  472  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  53.65 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  48.08 
 
 		 476 aa  458  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  51.71 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  55.77 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  50.6 
 
 		 515 aa  420  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  48.29 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  52.36 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  49.26 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.4 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  57.42 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  57.69 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  49.79 
 
 		 482 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  48.5 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  46.12 
 
 		 473 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  56.84 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  47.02 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  46.14 
 
 		 468 aa  382  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.83 
 
 		 503 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  48.03 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  47.42 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  43.34 
 
 		 496 aa  359  6e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 487 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.98 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 		 524 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.98 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.16 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  40.99 
 
 		 482 aa  312  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  41.2 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  39.7 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  39.7 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  39.7 
 
 		 476 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  39.61 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  41.88 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 531 aa  269  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  52.43 
 
 		 568 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.76 
 
 		 545 aa  266  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 		 560 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 534 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 580 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 		 528 aa  209  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  35.14 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 510 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 554 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 523 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 555 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 547 aa  139  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.51 
 
 		 535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 537 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 547 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.62 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 563 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 530 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 536 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.02 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 		 549 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.59 
 
 		 556 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.73 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 		 547 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.3 
 
 		 527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 556 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 514 aa  116  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 539 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  26.27 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 535 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 564 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 524 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.04 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 545 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 532 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 565 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>