130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2127 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  73.6 
 
 		 491 aa  718    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  73.6 
 
 		 491 aa  718    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  949    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  73.74 
 
 		 476 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  88.38 
 
 		 482 aa  855    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  70.46 
 
 		 480 aa  658    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  54.23 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  55.21 
 
 		 503 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  54.4 
 
 		 499 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  51.54 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  51.77 
 
 		 479 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 484 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  48.84 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  47.65 
 
 		 487 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  43.31 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 515 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  42.89 
 
 		 473 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 		 481 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 474 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  44.61 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 474 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  40.5 
 
 		 478 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  41.85 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  40.08 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  40.99 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  40.94 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  36.42 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  45.4 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  42.04 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  42.71 
 
 		 469 aa  302  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.83 
 
 		 469 aa  299  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.61 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  53.47 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.83 
 
 		 511 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  44.75 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  44.98 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  40.13 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  33.53 
 
 		 530 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.69 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 531 aa  163  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 526 aa  140  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.79 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 533 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 523 aa  97.8  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 554 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 580 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 535 aa  94  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 523 aa  90.5  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 559 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.8 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  23.39 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  22.96 
 
 		 556 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.1 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  20.22 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.04 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.06 
 
 		 545 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  29.17 
 
 		 532 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.55 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.91 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  21.42 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 532 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  24.28 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  21.85 
 
 		 556 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  28.75 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  21.61 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  23.08 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>