193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0562 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  65.53 
 
 
477 aa  667    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  984    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  64.33 
 
 
476 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  65.02 
 
 
484 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  60.13 
 
 
478 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  56.03 
 
 
474 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  56.08 
 
 
474 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  53.22 
 
 
476 aa  518  1e-146  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  52.56 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  54.41 
 
 
487 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  50.96 
 
 
472 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  48.29 
 
 
465 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  47.26 
 
 
506 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
515 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  45.84 
 
 
473 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  48.83 
 
 
505 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  44.87 
 
 
479 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  45.51 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 
472 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  46.02 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  49.57 
 
 
474 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 
481 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  47.02 
 
 
482 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  45.38 
 
 
491 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 
474 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  49.57 
 
 
474 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 
484 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 
469 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 
487 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.96 
 
 
503 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.56 
 
 
477 aa  349  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  38.81 
 
 
496 aa  339  5e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 
524 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  41.77 
 
 
511 aa  336  5e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40 
 
 
499 aa  335  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.3 
 
 
469 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  38.97 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  39.87 
 
 
491 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  40.08 
 
 
482 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  37.26 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  37.26 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  37.26 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  38.2 
 
 
482 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  36.81 
 
 
437 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  33.13 
 
 
545 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
531 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
530 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 
568 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
530 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
530 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
526 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
534 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
528 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 
560 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
528 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
534 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
580 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  32 
 
 
530 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 
523 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
522 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
528 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
533 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
547 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.7 
 
 
535 aa  143  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
524 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
565 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 
531 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
559 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
537 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.05 
 
 
556 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 
554 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
564 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
537 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  27.15 
 
 
527 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
556 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.65 
 
 
533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
533 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.72 
 
 
563 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 
531 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
547 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
561 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
552 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 
536 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
539 aa  121  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
523 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
535 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
536 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  25.51 
 
 
536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
547 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
545 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  23.43 
 
 
529 aa  107  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
514 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 
517 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  23.77 
 
 
530 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>