127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2860 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 468 aa  932    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  56.72 
 
 		 473 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  53.3 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  53.73 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  48.59 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  44.73 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  46.12 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 		 474 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  44.52 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  48.5 
 
 		 505 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  48.27 
 
 		 487 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  45.42 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  45.92 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  43.13 
 
 		 465 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  42.27 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  40.43 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  47.59 
 
 		 511 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.16 
 
 		 503 aa  355  6.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  49.79 
 
 		 474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  42.34 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  42.77 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 		 515 aa  348  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.52 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  49.36 
 
 		 474 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  44.21 
 
 		 469 aa  339  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 		 484 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  40.86 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  40.86 
 
 		 491 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  40.86 
 
 		 491 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  49.14 
 
 		 474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  42.16 
 
 		 482 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  39.75 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  39.35 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  38.23 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  42.95 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  38.27 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  46.07 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 560 aa  199  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.53 
 
 		 545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 530 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 530 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 530 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 		 534 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  32.91 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 523 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.47 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 		 523 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 533 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.13 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  23.28 
 
 		 556 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 		 531 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 531 aa  86.7  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 524 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.89 
 
 		 563 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.48 
 
 		 564 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  22.1 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  21.81 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  21.71 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 547 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.1 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.63 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 		 536 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 		 547 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  21.44 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 555 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  22 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  25.51 
 
 		 545 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  27.47 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  27.47 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  24.34 
 
 		 533 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  36.08 
 
 		 527 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  20.86 
 
 		 561 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  25.33 
 
 		 551 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  22.85 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>