More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4024 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  69.2 
 
 
554 aa  745    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  65.93 
 
 
554 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
547 aa  1134    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  66.85 
 
 
559 aa  747    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 
514 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  41.32 
 
 
556 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  44.59 
 
 
510 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  44.09 
 
 
510 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  43.1 
 
 
545 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  43.83 
 
 
510 aa  389  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 
551 aa  352  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  40.53 
 
 
526 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
563 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 
547 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
556 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  35.91 
 
 
561 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
564 aa  297  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 
565 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
516 aa  294  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
518 aa  277  3e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
555 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
537 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
549 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  33.33 
 
 
533 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  35.75 
 
 
527 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
536 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
547 aa  246  6e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
533 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  34.8 
 
 
532 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  34.62 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 
530 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
537 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  33.21 
 
 
530 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
536 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  32.47 
 
 
531 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  32.01 
 
 
530 aa  226  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
531 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
536 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 
531 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
532 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
535 aa  220  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
535 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
552 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  31.28 
 
 
529 aa  213  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
524 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.33 
 
 
527 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
528 aa  197  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
545 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
536 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
517 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
523 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
531 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.92 
 
 
548 aa  163  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.2 
 
 
520 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
520 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
520 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
520 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.4 
 
 
545 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
532 aa  158  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
519 aa  154  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
533 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  26.4 
 
 
536 aa  151  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
523 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
534 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
521 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 
524 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
474 aa  144  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 
526 aa  140  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
531 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
560 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  28.57 
 
 
498 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 
534 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 
531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
528 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
474 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
523 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.69 
 
 
507 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.9 
 
 
505 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.02 
 
 
535 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
530 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
530 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
530 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.64 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 
528 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 
478 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.97 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.09 
 
 
518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
580 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  25.7 
 
 
476 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
477 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>