More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1677 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  69.52 
 
 
536 aa  767    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  77.41 
 
 
520 aa  841    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
519 aa  1059    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  77.41 
 
 
520 aa  841    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  61 
 
 
528 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  89.6 
 
 
520 aa  965    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  77.61 
 
 
520 aa  843    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
547 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
555 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  30.42 
 
 
527 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
549 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.47 
 
 
533 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  27.44 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
559 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
531 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.17 
 
 
530 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
535 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 
533 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
536 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
554 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
531 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.01 
 
 
530 aa  156  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 
535 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
554 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
564 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
547 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 
539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
530 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
565 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
556 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
536 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.38 
 
 
556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
510 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
532 aa  139  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 
547 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 
536 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.38 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
563 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  27.42 
 
 
532 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  27.42 
 
 
532 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
528 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 
514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.52 
 
 
510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.01 
 
 
545 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
532 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
527 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 
523 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
561 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  28.43 
 
 
498 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
551 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  26.09 
 
 
535 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25.61 
 
 
508 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  25.93 
 
 
508 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  25.05 
 
 
505 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22.77 
 
 
512 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  23.23 
 
 
506 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.38 
 
 
522 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 
531 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 
506 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22.58 
 
 
512 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 
506 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
531 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  26.52 
 
 
526 aa  96.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 
545 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
512 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 
530 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  24.04 
 
 
503 aa  94.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  26.97 
 
 
504 aa  94  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25 
 
 
503 aa  93.6  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  23.88 
 
 
531 aa  90.9  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
521 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
505 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
530 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
497 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  22.2 
 
 
509 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 
497 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 
532 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  24.62 
 
 
492 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  24.75 
 
 
513 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
515 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  23.54 
 
 
520 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  26.1 
 
 
507 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  25.91 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  22.57 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
512 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  22.72 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 
503 aa  84  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
523 aa  84  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 
526 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>