More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0637 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  100 
 
 		 548 aa  1107    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  39.92 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 556 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.96 
 
 		 563 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  29.24 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 565 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 516 aa  182  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 547 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  29.29 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.55 
 
 		 554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 549 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  31.79 
 
 		 530 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.55 
 
 		 533 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.63 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 		 536 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  29.05 
 
 		 530 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 		 528 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 536 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  31.45 
 
 		 532 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.27 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 514 aa  140  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.62 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 535 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 536 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.24 
 
 		 539 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 552 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.47 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 524 aa  130  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  26.31 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.29 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 534 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  25.92 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.65 
 
 		 527 aa  123  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.04 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 545 aa  118  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  29.89 
 
 		 523 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.1 
 
 		 510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 		 469 aa  115  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  27.66 
 
 		 545 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 		 551 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  21.92 
 
 		 537 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 528 aa  114  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 560 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.52 
 
 		 470 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  28.71 
 
 		 472 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 532 aa  107  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  23.86 
 
 		 511 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  22.81 
 
 		 492 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  22.99 
 
 		 511 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.67 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.47 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  23.47 
 
 		 511 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  26.44 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 481 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  25.96 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 531 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 528 aa  97.8  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 487 aa  95.9  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 527 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  25.24 
 
 		 507 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 520 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 520 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 520 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 531 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 506 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  26.75 
 
 		 495 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 528 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>