223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4444 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
523 aa  1034    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  31.57 
 
 
529 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
547 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
564 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
565 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.03 
 
 
527 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
556 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 
563 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
561 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 
554 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 
510 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  29.68 
 
 
554 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
559 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 
528 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.42 
 
 
524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.48 
 
 
510 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
514 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  31.78 
 
 
510 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 
530 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
547 aa  148  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
523 aa  147  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
531 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
506 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
530 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 
530 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
518 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
516 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.52 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
474 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
517 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
555 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
528 aa  123  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  27.81 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.63 
 
 
545 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 
545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 
476 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  26.97 
 
 
533 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 
539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.09 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  31.47 
 
 
526 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
474 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 
551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
549 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  28.89 
 
 
515 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
580 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
534 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
536 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 
536 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
537 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 
531 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
505 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
533 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  23.71 
 
 
476 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 
560 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.37 
 
 
535 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 
535 aa  104  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.2 
 
 
545 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  26.97 
 
 
531 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  27.74 
 
 
473 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.54 
 
 
527 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 
531 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
523 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
487 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.89 
 
 
548 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 
531 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
481 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  27.13 
 
 
465 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  27 
 
 
479 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
534 aa  100  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
466 aa  100  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 
491 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  28.01 
 
 
530 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.84 
 
 
511 aa  99.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.26 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.46 
 
 
470 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
536 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
552 aa  96.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 
526 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
535 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
524 aa  91.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.27 
 
 
499 aa  91.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 
531 aa  91.3  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
528 aa  90.5  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  29.01 
 
 
482 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
537 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  26.55 
 
 
491 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  26.55 
 
 
491 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  26.69 
 
 
476 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
523 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>