More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1673 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  58.61 
 
 
533 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
537 aa  1105    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  67.91 
 
 
539 aa  727    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  69.62 
 
 
533 aa  750    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  67.54 
 
 
549 aa  730    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  59.58 
 
 
527 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  60.08 
 
 
547 aa  633  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  58.46 
 
 
537 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  60.26 
 
 
536 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  59.7 
 
 
536 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 
535 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  59.03 
 
 
552 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 
535 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  44.28 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 
518 aa  431  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 
536 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  43.92 
 
 
532 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  44.11 
 
 
532 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  43.35 
 
 
532 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  39.93 
 
 
530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  39.7 
 
 
530 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  40.45 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  39.89 
 
 
531 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  39.89 
 
 
531 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
534 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  37.27 
 
 
554 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
559 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  35.23 
 
 
530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
554 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  32.77 
 
 
556 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
547 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
536 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
564 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
556 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 
563 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
565 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
528 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
532 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 
514 aa  200  5e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.94 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
523 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.29 
 
 
510 aa  191  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  31.37 
 
 
545 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
519 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
527 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 
531 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.76 
 
 
527 aa  168  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  26.79 
 
 
510 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 
505 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.22 
 
 
536 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
531 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
520 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
528 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
517 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
520 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
551 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
520 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
430 aa  146  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.57 
 
 
548 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
545 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  31.58 
 
 
504 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.04 
 
 
520 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
523 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.38 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  27.14 
 
 
526 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
524 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
530 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.85 
 
 
545 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 
557 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 
531 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
521 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
560 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  25.56 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
522 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  28.85 
 
 
516 aa  117  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  25.67 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  25.38 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  26.36 
 
 
525 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
528 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.09 
 
 
535 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  28.31 
 
 
520 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  27.85 
 
 
529 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  25.39 
 
 
505 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>