138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0674 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  100 
 
 		 529 aa  1061    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  63.22 
 
 		 516 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  62.72 
 
 		 520 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  59.85 
 
 		 535 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  62.7 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  62.7 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  62.7 
 
 		 499 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  53.23 
 
 		 505 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  54.67 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  53.71 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.19 
 
 		 520 aa  442  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.26 
 
 		 523 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 		 513 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.68 
 
 		 517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  42.2 
 
 		 522 aa  346  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 555 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 537 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  29.21 
 
 		 527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  28.17 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 536 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  29.75 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 536 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 		 527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 549 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 539 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.22 
 
 		 531 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 531 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  25.68 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  27.62 
 
 		 532 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  27.62 
 
 		 532 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 533 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 532 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 430 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 559 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 554 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  26.21 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  22.97 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 563 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  22.32 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.49 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  24.38 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.39 
 
 		 527 aa  67  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.52 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.3 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  24.32 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.53 
 
 		 548 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  37.78 
 
 		 545 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  55.32 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 519 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  27.41 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  65.79 
 
 		 522 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 531 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 		 528 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 526 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  41.82 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  22.39 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>