101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8148 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 557 aa  1114    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  55.09 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  55.83 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  56.41 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.32 
 
 		 520 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.75 
 
 		 517 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.99 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  47.08 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  52.32 
 
 		 522 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  48.18 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  49.53 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  47.86 
 
 		 535 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  47.65 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  47.97 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  47.97 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  47.97 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 536 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 		 549 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 		 518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 523 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 533 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 537 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 531 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  33.63 
 
 		 532 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  33.16 
 
 		 532 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  27.83 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 539 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  28.88 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 552 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 536 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  26.29 
 
 		 530 aa  90.5  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.59 
 
 		 530 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.26 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.14 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  23.7 
 
 		 556 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.24 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.31 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  28.01 
 
 		 545 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 528 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.04 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  22.69 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  24.56 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 532 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  21.84 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.69 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 547 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.31 
 
 		 503 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 519 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 520 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  24.07 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 		 521 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 547 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.22 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  64.86 
 
 		 522 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  60.98 
 
 		 548 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  45.21 
 
 		 510 aa  50.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  30.7 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 564 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 534 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  53.85 
 
 		 529 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  25.28 
 
 		 470 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 523 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 397 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 517 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  25.97 
 
 		 496 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 		 468 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 520 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.39 
 
 		 545 aa  43.5  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>