140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4868 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 517 aa  1000    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  60.42 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  56.31 
 
 		 505 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  57.34 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.45 
 
 		 520 aa  475  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  52.75 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.83 
 
 		 523 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  51.45 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  49.81 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  50.09 
 
 		 535 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  48.65 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  49.24 
 
 		 520 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  46.72 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  48.77 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  48.77 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  48.77 
 
 		 499 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  32.94 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 555 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 527 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 547 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  31.81 
 
 		 552 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  29.8 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  31.17 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 536 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  27.86 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 531 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.57 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.57 
 
 		 532 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  33.68 
 
 		 532 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  24.09 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 539 aa  94  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.43 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 536 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 530 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 563 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  22.14 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.19 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.62 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.72 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 523 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.4 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 528 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.82 
 
 		 564 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.59 
 
 		 545 aa  63.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 514 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 524 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.69 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  28.49 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0345  hypothetical protein  22.81 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.04 
 
 		 548 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  27.52 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 534 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.62 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  48.65 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  38.46 
 
 		 545 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  30.11 
 
 		 469 aa  56.6  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 524 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 469 aa  53.9  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 		 526 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  57.14 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  50.88 
 
 		 545 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  23.84 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  24.1 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 520 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  46.97 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  28.15 
 
 		 476 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>