More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1271 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  100 
 
 
530 aa  1087    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  41.7 
 
 
555 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 
530 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 
536 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  39.58 
 
 
532 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  39.39 
 
 
532 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  37.9 
 
 
530 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 
532 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
537 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
518 aa  316  6e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
549 aa  312  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
534 aa  312  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
533 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  35.85 
 
 
531 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  34.34 
 
 
533 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
516 aa  307  3e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
535 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
531 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
535 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  35.66 
 
 
536 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 
539 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
536 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
536 aa  294  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
537 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  34.03 
 
 
527 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
552 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  34.28 
 
 
554 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
554 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
559 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
532 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
547 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  32.02 
 
 
556 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
547 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
564 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
563 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
561 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 
565 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
514 aa  216  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.1 
 
 
510 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
528 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  30.13 
 
 
510 aa  191  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 
520 aa  180  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 
520 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
520 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
520 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
519 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
530 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
531 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 
533 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
523 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  27.69 
 
 
545 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
531 aa  154  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
528 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 
527 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.53 
 
 
545 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.78 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
531 aa  143  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 
524 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.05 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
531 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
517 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.32 
 
 
526 aa  140  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  24.55 
 
 
536 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
526 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
551 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 
528 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
545 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.19 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 
534 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
524 aa  124  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 
560 aa  124  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
522 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  27.64 
 
 
529 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.09 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.18 
 
 
520 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 
534 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.67 
 
 
492 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.96 
 
 
511 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.57 
 
 
472 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  25.63 
 
 
520 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  27.31 
 
 
504 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
481 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  27.18 
 
 
498 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  24.57 
 
 
511 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.62 
 
 
511 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>