172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2057 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
487 aa  956    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  61.15 
 
 
503 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  60 
 
 
496 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  58.81 
 
 
499 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  60.13 
 
 
491 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  54.41 
 
 
491 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  54.41 
 
 
491 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  54.21 
 
 
476 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  52.58 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  51.04 
 
 
479 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  51.54 
 
 
482 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  50.31 
 
 
482 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  50.52 
 
 
482 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 
484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
478 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
484 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  43.37 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  43.8 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
474 aa  351  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
477 aa  349  8e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  42.77 
 
 
468 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
474 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  43.13 
 
 
470 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 
487 aa  343  5.999999999999999e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  44.16 
 
 
472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 
476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 
515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
491 aa  323  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  61.17 
 
 
568 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  42.44 
 
 
506 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  39.79 
 
 
472 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  46.58 
 
 
477 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 
481 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  46.07 
 
 
505 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
474 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  42.37 
 
 
465 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  35.52 
 
 
476 aa  302  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.1 
 
 
469 aa  301  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
469 aa  296  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  47.9 
 
 
474 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 
474 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.62 
 
 
511 aa  285  9e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  37.45 
 
 
524 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  39.16 
 
 
437 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 
530 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
534 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.11 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 
526 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
528 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  30.93 
 
 
530 aa  146  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
528 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  28.28 
 
 
535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
523 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  25.52 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
531 aa  110  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 
580 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
564 aa  97.8  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  21.73 
 
 
547 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
547 aa  88.6  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 
554 aa  86.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.39 
 
 
556 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.29 
 
 
510 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  26.97 
 
 
527 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
514 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.62 
 
 
529 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.43 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.19 
 
 
528 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.89 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.83 
 
 
563 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  22.37 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 
524 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
545 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  23.57 
 
 
559 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
523 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  23.99 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 
537 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 
547 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  25.75 
 
 
510 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  23.81 
 
 
536 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
519 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  27.75 
 
 
548 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 
534 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  26.54 
 
 
535 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 
536 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  21.87 
 
 
555 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.33 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>