261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1758 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
534 aa  1030    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  90.64 
 
 
534 aa  861    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  58.97 
 
 
545 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  56.89 
 
 
531 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  57.36 
 
 
530 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  52.43 
 
 
530 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  52.43 
 
 
530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  52.69 
 
 
560 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  52.43 
 
 
530 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  56.39 
 
 
580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  49.11 
 
 
526 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  50.91 
 
 
528 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  48.02 
 
 
528 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 
524 aa  306  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
506 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  39.29 
 
 
470 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 
487 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
515 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
474 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 
474 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
505 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  35.18 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  35.86 
 
 
472 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 
523 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
469 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  28.24 
 
 
476 aa  225  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
474 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.7 
 
 
469 aa  224  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  32.14 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
476 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 
481 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  41.21 
 
 
474 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
466 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  37.8 
 
 
511 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 
472 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
484 aa  210  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
484 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  35.18 
 
 
473 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
477 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
533 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
491 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 
556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  31.36 
 
 
554 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 
468 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 
554 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  35.11 
 
 
503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  34.51 
 
 
487 aa  183  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 
565 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  26.5 
 
 
564 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  31.96 
 
 
535 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  32.87 
 
 
479 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
547 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  34.97 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 
563 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  33.53 
 
 
482 aa  173  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
528 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  33.66 
 
 
482 aa  169  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
522 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  32.69 
 
 
499 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
561 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
531 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
531 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  31.81 
 
 
482 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
510 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.77 
 
 
524 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  32.62 
 
 
491 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  32.62 
 
 
491 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  32.62 
 
 
476 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  32.67 
 
 
437 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  32.11 
 
 
480 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  30.91 
 
 
496 aa  157  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
491 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 
547 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.04 
 
 
527 aa  146  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
536 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.27 
 
 
510 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
523 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
555 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  25.65 
 
 
556 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  30.94 
 
 
533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  32.52 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.52 
 
 
532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  32.15 
 
 
527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  26.67 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
568 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
539 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  28.33 
 
 
530 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  29.94 
 
 
531 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 
532 aa  123  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 
530 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 
531 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>