More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0226 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
518 aa  1051    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  73.79 
 
 
516 aa  793    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 
537 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
547 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 
533 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  40.75 
 
 
533 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 
536 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 
549 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  41.28 
 
 
536 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
555 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
535 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  39.55 
 
 
527 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 
552 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
536 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  41.17 
 
 
535 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  38.72 
 
 
539 aa  375  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  41.13 
 
 
532 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  41.32 
 
 
532 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 
554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  36.52 
 
 
530 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
554 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  33.65 
 
 
530 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
559 aa  296  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 
531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  34.84 
 
 
531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 
531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
547 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
556 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  34.59 
 
 
556 aa  263  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
547 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
510 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
564 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
514 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 
536 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 
565 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 
561 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  31.17 
 
 
510 aa  216  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.87 
 
 
510 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  29.37 
 
 
545 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
528 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 
523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
532 aa  183  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
520 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 
527 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.87 
 
 
526 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 
524 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
517 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.57 
 
 
527 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
551 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
430 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.29 
 
 
536 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
505 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
545 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.36 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
528 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  25.52 
 
 
548 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 
523 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 
533 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
523 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  28.84 
 
 
504 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 
524 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  28.04 
 
 
529 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
516 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
521 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.21 
 
 
545 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
530 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 
523 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
530 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  24.33 
 
 
530 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  25.41 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 
531 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  26.09 
 
 
516 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 
474 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.43 
 
 
523 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
513 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
474 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 
534 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 
526 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  24.71 
 
 
537 aa  103  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  25 
 
 
518 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 
522 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
420 aa  101  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 
534 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  24.85 
 
 
505 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  24.9 
 
 
525 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  22.99 
 
 
535 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 
531 aa  98.2  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  24.36 
 
 
535 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  22.94 
 
 
507 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>