137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2540 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 397 aa  818    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  74.49 
 
 		 399 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  71.72 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  70.78 
 
 		 398 aa  595  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  68.51 
 
 		 412 aa  584  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  66.84 
 
 		 396 aa  565  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  65.57 
 
 		 396 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  49.75 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  43.47 
 
 		 399 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  36.48 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  36.48 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  36.66 
 
 		 400 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  35.57 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  22.65 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  44.87 
 
 		 647 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  23.04 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  21.1 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  22.07 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 		 722 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  38.46 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  21.7 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.32 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  22.11 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  40.79 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  40.79 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  19.67 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  32.05 
 
 		 599 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.15 
 
 		 642 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  27.78 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  34.62 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.95 
 
 		 640 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  33.33 
 
 		 624 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  33.33 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  32.53 
 
 		 639 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 469 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  21.67 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.38 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  20.47 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  20.47 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 471 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  22.78 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  20.54 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  19.74 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.12 
 
 		 643 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  29.49 
 
 		 552 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  31.03 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 479 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.96 
 
 		 639 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  35.06 
 
 		 463 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  31 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  32.05 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30.77 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  29.27 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  21.93 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  20.75 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  32.05 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30.77 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 547 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  27.05 
 
 		 525 aa  47.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  21.36 
 
 		 466 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30.77 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  22.15 
 
 		 461 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  37.84 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 549 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  39.68 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 		 537 aa  46.6  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  31.31 
 
 		 486 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  30.39 
 
 		 478 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  34.21 
 
 		 460 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  21.19 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  30.3 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.89 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  31.87 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  36 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  52.78 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  21.43 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  37.5 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  31.71 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  39.06 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  23.74 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  37.18 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  37.5 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  27.35 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  30.28 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  40 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  47.37 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 557 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  18.85 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  56.25 
 
 		 271 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  29.49 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>