119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0218 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  100 
 
 		 399 aa  817    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  95.99 
 
 		 399 aa  789    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  62.03 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  45.71 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  44.76 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  43.83 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  43.47 
 
 		 397 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  42.97 
 
 		 396 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 399 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  42.68 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  42.68 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  42.25 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  40.41 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.81 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  25.91 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  21.46 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  22.32 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  23.92 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 722 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  24.25 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  22.27 
 
 		 482 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  23.83 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  23.92 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  23.03 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  48.39 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  19.79 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  22.81 
 
 		 436 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  19.28 
 
 		 473 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.02 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  19.58 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  20.87 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  21.51 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  21.78 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  19.79 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  19.62 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  19.62 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  19.62 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  24.14 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  53.45 
 
 		 545 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  21.9 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  21.9 
 
 		 436 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.99 
 
 		 469 aa  49.7  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.33 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4014  UDP-galactopyranose mutase  35.06 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  21.53 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  39.74 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  21.38 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  37.18 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  30 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  23.47 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  21.3 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  23 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  21.18 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54800  carotenoid isomerase-like protein  45.83 
 
 		 923 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0759229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  21.83 
 
 		 509 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  20.94 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  26.23 
 
 		 492 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.78 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  30.68 
 
 		 552 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4106  UDP-galactopyranose mutase  35.06 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  22.18 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.56 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  22.26 
 
 		 437 aa  46.2  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 536 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  55 
 
 		 547 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  27.62 
 
 		 471 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.91 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  19.42 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  38.36 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  37.84 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  22.54 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  31.51 
 
 		 463 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  23.13 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.62 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  25.96 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  23.26 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  27.91 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  24.63 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  26.92 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  28.75 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  24.12 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  42.86 
 
 		 556 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  27.27 
 
 		 518 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  37.18 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33.33 
 
 		 599 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  23.72 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>