168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2137 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  76.65 
 
 		 396 aa  638    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  100 
 
 		 396 aa  816    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  65.57 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  65.82 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  64.89 
 
 		 397 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  63.04 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  62.94 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  47.7 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  42.97 
 
 		 399 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  39.15 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  38.65 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  38.65 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  37.02 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.81 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  31.75 
 
 		 599 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 		 722 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  29.31 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  27.78 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  21.93 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  21.93 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  20.98 
 
 		 475 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.71 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.05 
 
 		 474 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  24.61 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 477 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  30.49 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.16 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.05 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  31.71 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  23.08 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  21.12 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  32.05 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  33.33 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  23.06 
 
 		 482 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  23.63 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  21.77 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  23.33 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  24.46 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  23.69 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  23.69 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  26.32 
 
 		 492 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  32.89 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  32.89 
 
 		 647 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  24.61 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0465  thioredoxin reductase  44.23 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  26.32 
 
 		 503 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 473 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  32.05 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  20.78 
 
 		 509 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  32.05 
 
 		 464 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  32.05 
 
 		 462 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  30.77 
 
 		 472 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.77 
 
 		 647 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  26.09 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.49 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  22.45 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  34.83 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  32.47 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  43.33 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  26.92 
 
 		 506 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  34.38 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  24.18 
 
 		 711 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  30.95 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  28.87 
 
 		 484 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  19.82 
 
 		 511 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.11 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  26.96 
 
 		 500 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.96 
 
 		 640 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  63.89 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  34.72 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  28 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  28.21 
 
 		 645 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  27.84 
 
 		 484 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  61.11 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.32 
 
 		 639 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  27.5 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  53.49 
 
 		 245 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.12 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.11 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  27.84 
 
 		 484 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  29.76 
 
 		 474 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  26.95 
 
 		 505 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  33.82 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  26.15 
 
 		 506 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  26.09 
 
 		 500 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  26.15 
 
 		 506 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  33.33 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  64.71 
 
 		 271 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 545 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 		 318 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  21.94 
 
 		 439 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.89 
 
 		 317 aa  46.2  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>