More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1411 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  100 
 
 
267 aa  528  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  81.4 
 
 
271 aa  412  1e-114  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.82 
 
 
263 aa  296  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  62.15 
 
 
275 aa  290  1e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  59.36 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  57.36 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  59.68 
 
 
273 aa  281  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.16 
 
 
261 aa  231  9e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.4 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 
263 aa  219  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.39 
 
 
262 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.39 
 
 
261 aa  218  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.39 
 
 
261 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.94 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.15 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.98 
 
 
286 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  43.24 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.79 
 
 
258 aa  198  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.46 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  43.8 
 
 
254 aa  183  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.06 
 
 
260 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.41 
 
 
256 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.43 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.03 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.94 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.29 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.13 
 
 
254 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  37.32 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.77 
 
 
309 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  37.5 
 
 
309 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.92 
 
 
308 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.3 
 
 
307 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.65 
 
 
258 aa  149  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.68 
 
 
272 aa  145  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.33 
 
 
277 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  33.58 
 
 
331 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  34.63 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
438 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  40 
 
 
529 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  32.58 
 
 
455 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  30.24 
 
 
468 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  59.52 
 
 
396 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.57 
 
 
430 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 
431 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  34.15 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 
438 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  53.49 
 
 
470 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  33.62 
 
 
449 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  35.87 
 
 
384 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  56.1 
 
 
484 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
432 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 
434 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.18 
 
 
555 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  32.03 
 
 
452 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.85 
 
 
551 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1612  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  30.63 
 
 
551 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249988  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.45 
 
 
556 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0649357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3106  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
472 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  34.11 
 
 
432 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  34.88 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6359  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.45 
 
 
556 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120399  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.58 
 
 
446 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.03 
 
 
443 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  31.03 
 
 
443 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  34.48 
 
 
446 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  34.48 
 
 
446 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.12 
 
 
434 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1434  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  37.21 
 
 
436 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000988984  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  54.76 
 
 
396 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  32.43 
 
 
405 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.45 
 
 
423 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1822  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  34.75 
 
 
431 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.170222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.84 
 
 
895 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  57.58 
 
 
991 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.33 
 
 
453 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00401797  normal  0.0849799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
429 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4965  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.02 
 
 
466 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 
394 aa  46.6  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30 
 
 
914 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1925  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.5 
 
 
561 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0956827  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  29.41 
 
 
541 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  57.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1370  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  35.8 
 
 
434 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.82 
 
 
652 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
430 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  26.38 
 
 
494 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  51.16 
 
 
559 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45 
 
 
318 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  43.33 
 
 
418 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  27.66 
 
 
545 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.41 
 
 
541 aa  45.8  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.03 
 
 
445 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  56.41 
 
 
399 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2315  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  33.73 
 
 
436 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0377746  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 
318 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 
547 aa  45.8  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.66 
 
 
457 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
520 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  51.16 
 
 
554 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>