205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0226 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  98.47 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  98.08 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  91.19 
 
 		 261 aa  462  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  73.54 
 
 		 263 aa  362  4e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  51.75 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  51.41 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.42 
 
 		 268 aa  230  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.74 
 
 		 259 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.61 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.77 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.67 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.84 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.1 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.19 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  44.88 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.66 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.45 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.38 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  43.08 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.75 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.91 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.63 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  45.53 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  42.75 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.27 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.87 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.02 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.81 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  35.23 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.61 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  34.64 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.68 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.19 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  30.56 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.29 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  32.59 
 
 		 425 aa  52.4  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  57.14 
 
 		 462 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 		 471 aa  49.3  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.98 
 
 		 555 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  29.93 
 
 		 435 aa  48.9  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 430 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 431 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1486  glutamate synthase, small subunit  36.67 
 
 		 452 aa  48.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.622168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  54.55 
 
 		 463 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.57 
 
 		 545 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  51.02 
 
 		 512 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 431 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  67.65 
 
 		 445 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  38.89 
 
 		 563 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  28.99 
 
 		 428 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  28.99 
 
 		 428 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  31.16 
 
 		 430 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.28 
 
 		 551 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.67 
 
 		 570 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  59.46 
 
 		 529 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  27.54 
 
 		 428 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  35.21 
 
 		 544 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0047  putative oxidoreductase FixC  28.26 
 
 		 428 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 		 382 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.08 
 
 		 539 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  28.99 
 
 		 428 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00047  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  28.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00046  hypothetical protein  28.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  31.4 
 
 		 410 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  28.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3612  putative oxidoreductase FixC  28.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  28.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0298  glutamate synthase subunit beta  41.18 
 
 		 472 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.34 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.34 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 445 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  58.82 
 
 		 490 aa  45.4  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0304  glutamate synthase subunit beta  41.18 
 
 		 472 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  40.86 
 
 		 384 aa  45.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  42.42 
 
 		 402 aa  45.4  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  28.26 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  52.5 
 
 		 556 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  40.62 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.21 
 
 		 544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 427 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  40 
 
 		 578 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  39.34 
 
 		 399 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  39.71 
 
 		 563 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  29.79 
 
 		 430 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  47.73 
 
 		 468 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  25.69 
 
 		 541 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  39.71 
 
 		 563 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  38.24 
 
 		 560 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  29.52 
 
 		 467 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  40.62 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  46.94 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  40.62 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.78 
 
 		 602 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0188  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  46.67 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>